Koronavirus: mutacije

i Christiane Fux, medicinska urednica Ažurirano dana

Maximilian Reindl studirao je kemiju i biokemiju na LMU u Münchenu, a član je uredničkog tima -a od prosinca 2020. godine. Upoznat će se s vama o temama medicinske, znanstvene i zdravstvene politike kako bi bile razumljive i razumljive.

Još postova od Maximilian Reindl

Christiane Fux studirala je novinarstvo i psihologiju u Hamburgu. Iskusni medicinski urednik od 2001. godine piše članke u časopisima, vijesti i tekstove o svim mogućim zdravstvenim temama. Osim što radi za, Christiane Fux aktivna je i u prozi. Njezin prvi kriminalistički roman objavljen je 2012., a također piše, dizajnira i objavljuje vlastite kriminalističke predstave.

Još postova Christiane Fux Sav sadržaja provjeravaju medicinski novinari.

Trenutno, delta varijanta iz Sars-CoV-2 posebno zabrinjava stručnjake: ne samo da se čini zaraznijom, već je i opasnija od izvorne divlje vrste. Druge mutacije pokazale su se barem zaraznijim. Ovdje možete saznati koja svojstva imaju različite mutacije koronavirusa, gdje se šire i zašto cijepljenja i dalje jako dobro štite.

Mutacije su normalne

Pojava novih varijanti virusa nije ništa neobično: virusi - uključujući patogen Sars -CoV -2 - tijekom replikacije opetovano nasumično mijenjaju svoj genetski materijal. Većina takvih mutacija je besmislena. No, neke su korisne za virus i prevladavaju.

Na taj način virusi se mogu brzo prilagoditi okolini i svom domaćinu. To je dio njihove evolucijske strategije.

U međuvremenu su se sa Sars-CoV-2 pojavile takozvane "Varijante zabrinutosti" (VoC)-odnosno varijante koje zabrinjavaju stručnjake. Zajedničko im je to što su zarazniji od izvornog oblika Sars-CoV-2.

To su sljedeće četiri varijante:

• Alfa: Linija, također poznata kao B.1.1.7, širi se iz Velike Britanije.
• Beta: Linija, također poznata kao B.1.351, širi se iz Južne Afrike.
• Gama: Linija, također poznata kao P.1, širi se iz Brazila.
• Delta: Linija, također poznata kao B.1.617, širi se iz Indije.

Varijacije virusa grupirane su u takozvane kladove ili linije - istraživači stvaraju svojevrsno "obiteljsko stablo koronavirusa". Svaka je varijanta okarakterizirana prema svom genetskom sastavu i daje kombinaciju slova i brojki. Ne može se iz ove oznake utvrditi je li određeni soj virusa opasniji ili ne - koristi se samo za sustavno bilježenje i dokumentiranje.

Usput: Svjetska zdravstvena organizacija (WHO) nedavno je predložila uvođenje novih naziva za najvažnije varijante Sars-CoV-2. Prema WHO -u, pojedine varijante virusa sada će se imenovati uzlaznim redoslijedom prema grčkoj abecedi.

Ovaj novi, jednostavniji i iznad svega neutralni opis ima za cilj spriječiti izjednačavanje novih varijanti virusa s mjestom njihovog prvog otkrivanja. Time se nastoje spriječiti neopravdane i znanstveno neutemeljene stigme, diskriminacija i predrasude prema pojedinim zemljama u javnoj raspravi.

Najvjerojatnije. Studija iz Škotske objavljena u prestižnom časopisu The Lancet pokazuje da je rizik od bolničkog liječenja zbog infekcije Deltom dvostruko veći nego kod izvorne varijante.

Štite li cijepljenja od varijante Delta?

Da. BioNTech / Pfizer štiti 79 posto od bolesti protiv Delte nakon druge doze cijepljenja u usporedbi s 92 posto protiv alfa varijante, koja je u početku otkrivena u Velikoj Britaniji. Nakon cijepljenja AstraZenecom, zaštita nakon druge doze cijepljenja iznosi 60 posto u odnosu na 73 posto.

Ovi se brojevi odnose na blage i umjerene simptomatske tijekove. Ne uzima se u obzir koliko dobro cijepljenje štiti od teških bolesti i smrti. No, upravo bi ovdje ocjena zaštite mogla biti znatno bolja.

Delta virus - imunološke činjenice

Delta varijanta koronavirusa (B.1.617) prvi je put pronađena u Indiji. Prikazuje tri podvarijante i kombinira nekoliko karakterističnih promjena. Takav je skup prvi put demonstriran u varijanti virusa.

S jedne strane, to su promjene proteina šiljaka, koji se smatra "ključem" za ljudsku stanicu. S druge strane, B.1.617 također prikazuje promjene o kojima se raspravlja kao o (mogućoj) biježnoj mutaciji.

Konkretno, B.1.617 kombinira sljedeće relevantne mutacije:

Mutacija D614G: Može učiniti koronavirus zaraznijim. Početno modeliranje pokazuje da se B.1.617 prenosi barem jednako lako kao i vrlo zarazna alfa varijanta (B.1.1.7).

Mutacija T478K: Dovodi do izmjene nenapunjene aminokiseline treonina lizinom na položaju 478, protoniranog u fiziološkim uvjetima - i stoga pozitivno nabijenog. Pretpostavlja se da ta izmjena aminokiselina utječe na interakciju s ACE2 receptorom. Stručnjaci sumnjaju da bi to moglo potaknuti ozbiljnije bolesti Covid-19.

Mutacija P681R: Istraživači to također povezuju s mogućom povećanom virulencijom.

Mutacija E484K: Također je pronađena u beta varijanti (B.1.351) i gama varijanti (P.1). Sumnja se da je virus učinio manje osjetljivim na neutraliziranje protutijela koja su već nastala.

Mutacija L452R: Također se raspravlja kao moguća mutacija bijega. Sojevi koronavirusa s mutacijom L452R bili su djelomično otporni na određena antitijela u laboratorijskim pokusima.

Druge poznate varijante virusa

Osim toga, razvile su se dodatne varijante virusa Sars-CoV-2 koje se razlikuju od divljeg tipa-no stručnjaci ih trenutno ne broje kao HOS-ove. Ti sojevi virusa nazivaju se "Varijante interesa" (VOI) - to jest varijante od posebnog interesa.

Još nije jasno kakav bi utjecaj ove nove VOI mogle imati na pandemiju. Ako se drže protiv virusa koji su već u opticaju, i oni bi se mogli nadograditi na odgovarajuće HOS -ove.

Varijante od posebnog interesa

Prema Europskom centru za prevenciju i kontrolu bolesti (ECDC), ovi VOI trenutno uključuju:

• Eta: dokazano u mnogim zemljama (B.1.525)
• Iota: prvi put otkrivena u SAD -u na području New Yorka (B.1.526)
• Kappa: prvi put otkriven u Indiji (B.1.617.1)
• Lambda: prvi put otkrivena u Peruu (c.37)

Osim toga, prema ECDC -u, postoje daljnji VOI koji još nisu opisani prema novoj nomenklaturi WHO -a:

• B. 1.620 nepoznatog podrijetla.
• B. 1.621 prvi put otkriven u Kolumbiji.

Prema informacijama ECDC -a i WHO -a, inačice koje su prethodno spomenute kao epsilon, zeta i theta više nisu dio VOI -ja. Varijanta B.1.616, koja je prvi put otkrivena u Francuskoj, također je dugo kružila bez značajnog utjecaja na pandemiju.

Promatrane varijante

Takozvane "Varijante pod nadzorom" (VUM) također su u proširenom fokusu - međutim, još uvijek postoji nedostatak pouzdanih, sustavnih podataka o njima. Većinom postoje samo dokazi o njihovom golom postojanju. Oni uključuju sporadične varijante ili "modificirane" - ili bolje rečeno, dalje razvijene - potomke već poznatih mutacija.

Prema ECDC -u, ti rijetki VUM trenutno uključuju:

• B.1.427 i B.1.429 - koju je WHO ranije nazivao Epsilon, sada snižena, prvo otkrivena u Kaliforniji.
• P.2 - WHO ga je prethodno zvao Zeta, a sada je snižen, prvi put otkriven u Brazilu.
• P.3 - WHO ga je prethodno nazivao theta, a sada je snižen, prvi put otkriven na Filipinima.
• B.1.214.2, A.27, A.28, C.16 i B.1.1.318 - varijante nepoznatog podrijetla.
• Druge varijante koje su prvi put otkrivene u Južnoj Africi: B.1.351 + E516Q i B.1.351 + P384L, C.1.2
• Druge varijante koje su prvi put otkrivene u Velikoj Britaniji: B.1.1.7 + L452R i B.1.1.7 + S494P, A.23.1 + E484K, AV.1, B.1.671.2 + K417N
• Druge varijante koje su prvi put otkrivene u SAD -u: B.1.526.1, B.1.526.2
• Varijanta koja je prvi put otkrivena u Rusiji: AT.1
• Varijanta koja je prvi put otkrivena u Egiptu: C.36 + L452R
• Varijanta koja je prvi put otkrivena u Meksiku: B.1.1.519

Iako je sada poznat veliki broj novih varijanti virusa, to ne znači automatski i veću prijetnju. U ovom trenutku procjena rizika još nije moguća. Ne može se predvidjeti niti utjecaj ovog VUM -a na (globalni) proces infekcije. Dakle, jesu li neke varijante virusa relevantne ili opasne, može se razjasniti samo daljnjim opažanjima.

Koliko su opasne mutacije koronavirusa?

Mutacije koronavirusa službeno klasificirane kao "varijante zabrinutosti", prema trenutnom stanju znanja, opasnije su od divljeg tipa koronavirusa. Vrlo su zarazne i njihove primjerene promjene (bijeg mutacija) mogle bi potaknuti sekundarne infekcije.

Međutim, opća procjena jesu li druge mutacije koronavirusa opasnije od izvornog patogena Sars-CoV-2 nije lako moguća. Nedostaje iskustvo i solidna baza podataka, osobito s novonastalim varijantama.

Što znači veća zarazna moć?

Ako Sars-CoV-2 postane zarazniji, bit će i teže zaustaviti njegovo širenje. Mjere koje su dosad uspješno suzbijale širenje možda više neće biti dovoljne.

Ako se, na primjer, vrijednost replikacije R za divlji oblik virusa smanji na 0,8 i postepeno smanjuje broj zaraženih, virus koji je oko 35 posto zarazniji bi se dalje proširio i pokrenuo lance infekcije ako poduzete su iste mjere.

Što to znači za cjepiva?

Na to nema općeg odgovora. Mogući smanjeni zaštitni učinak novorazvijenih cjepiva živo se raspravlja u stručnim krugovima. Do sada su proizvođači cjepiva i preliminarna istraživanja u tom pogledu dali sve jasno.

Na primjer, Comirnaty u početnim studijama pokazuje usporedivu učinkovitost u odnosu na alfa varijantu (B.1.1.7) i beta varijantu (B.1.351). Čini se da i VaxZevria pruža dobru zaštitu u B.1.1.7, ali bi se učinkovitost protiv linije B.1.351 mogla smanjiti.

U kojoj će se mjeri druga cjepiva iz Moderne i Johnson & Johnsona održati u borbi protiv modificiranih varijanti virusa, još nije do kraja razjašnjeno.

Kako virus napreduje, možda će biti potrebne prilagodbe cjepiva. Međutim, zbog napretka u razvoju cjepiva, to se može učiniti u kratkom vremenskom razdoblju. Međutim, sva cjepiva odobrena u Europskoj uniji i dalje pružaju učinkovitu i primjerenu zaštitu - osobito protiv teških i smrtonosnih tijekova Covid -19.

Više informacija o cjepivima protiv koronavirusa možete pronaći ovdje.

Koliko brzo Sars-CoV-2 mutira?

U budućnosti će se Sars-CoV-2 nastaviti prilagođavati imunološkom sustavu čovjeka i (djelomično) cijepljenoj populaciji putem mutacija. Koliko će se to brzo dogoditi uvelike ovisi o veličini aktivno zaražene populacije.

Što je više slučajeva zaraze - regionalnih, nacionalnih i međunarodnih - to se koronavirus više umnožava - i češće se javljaju mutacije.

U usporedbi s drugim virusima, koronavirus mutira relativno sporo. S ukupnom duljinom genoma Sars-CoV-2 od oko 30.000 parova baza, stručnjaci pretpostavljaju jednu do dvije mutacije mjesečno. Za usporedbu: Virusi gripe mutiraju dva do četiri puta češće u istom razdoblju.

Kako se mogu zaštititi od mutacija koronavirusa?

Ne možete se posebno zaštititi od pojedinačnih mutacija koronavirusa - jedina mogućnost je ne zaraziti se.

Općenito je pravilo da se pridržavate higijenskih pravila, držite distancu i nosite svoju masku FFP2 u javnosti. Ako se cijepite, uživat ćete i u dobrom osnovnom imunitetu protiv teških tečajeva.

Kako se otkrivaju mutacije koronavirusa?

Njemačka ima usko povezan sustav izvješćivanja za praćenje cirkulirajućih virusa Sars-CoV-2-naziva se "integrirani sustav molekularnog nadzora". U tu svrhu, nadležna zdravstvena tijela, Institut Robert Koch (RKI), specijalizirani dijagnostički laboratoriji i konzultantski laboratorij za koronavirus u berlinskoj Charité tijesno surađuju.

Kako funkcionira sustav izvještavanja ako se sumnja na mutaciju?

Prije svega, svaki profesionalno proveden pozitivan test na koronavirus potrebno je prijaviti nadležnom zdravstvenom tijelu.To uključuje testove na koronavirus koji su provedeni u testnom centru, kod vašeg liječnika, u vašoj ljekarni ili u državnim ustanovama - poput škola. Međutim, privatna samotestiranja isključena su iz toga.

Daljnje informacije o brzim testovima na koronavirus za osobnu uporabu mogu se pronaći u našoj temi Posebni samotesti za Corona.

Ako je rezultat pozitivan, liječnici šalju odgovarajući uzorak pacijenta u specijalizirani dijagnostički laboratorij, koji potvrđuje rezultat pomoću PCR testa. Ako je i PCR test pozitivan - uzorak se također može poslati u laboratorij za sekvenciranje gdje se može dodatno ispitati (analiza genoma za sekvenciranje).

RKI zatim uspoređuje izvještajne podatke i rezultat analize slijeda na pseudonimiziran način. Pseudonimizirano znači da nije moguće donijeti nikakve zaključke o jednoj osobi. Međutim, ove informacije čine bazu podataka za znanstvenike i dionike u zdravstvenom sustavu kako bi se dobio precizan pregled trenutne pandemijske situacije. To omogućuje najbolju moguću procjenu situacije kako bi se (ako je potrebno) donijele političke mjere.

Što je analiza genoma sekvenciranja?

Analiza genoma za sekvenciranje detaljna je genetska analiza. Ona ispituje točan slijed pojedinih komponenti RNA unutar virusnog genoma. To znači da se genom Sars-CoV-2, koji sadrži oko 30 000 parova baza, dešifrira i tada se može usporediti s genom divljeg tipa koronavirusa.

Samo se na taj način pojedinačne mutacije mogu prepoznati na molekularnoj razini - i moguće dodijeliti unutar "obiteljskog stabla koronavirusa".

Sekvenciranje genoma dugotrajan je i skup proces s (vrlo) ograničenim kapacitetima. Dakle, ne može se svaki pozitivan uzorak rutinski sekvencirati. Stručnjaci unaprijed odabiru - pa uzimaju uzorak.

Ovo također jasno pokazuje da ne može svaka država na svijetu detaljno pratiti točno širenje određenih varijanti koronavirusa. Stoga je vjerojatno da postoji izvjestan nedostatak jasnoće u dostupnim podacima izvješćivanja.

Oznake:  zdrava stopala droge prevencija